A região possui hospitais que servem de referência nacional na área de saúde especializada. No Hospital das Clínicas da Unesp de Botucatu são 13 especialidades ao todo. Jaú oferece o Hospital Amaral Carvalho como excelência no tratamento do câncer. Já Marília, que foi reconhecida inicialmente como especializada em ortopedia, hoje é modelo regional na urgência e emergência e nas cirurgias de várias especialidades, além de oncologia, cirurgia infantil e gestação de alto risco.
O Hospital Amaral Carvalho, referência em oncologia, é um dos melhores hospitais no atendimento a pacientes do Sistema Único de Saúde (SUS) e está localizado na cidade de Jaú (47 quilômetros a Leste de Bauru). A constatação foi do Ministério da Saúde, que conferiu ao hospital, em 2001, o Prêmio de Qualidade Hospitalar. O Amaral Carvalho foi escolhido entre 4.300 hospitais e ficou entre os 10 melhores de todo o País.
No ano passado, o hospital recebeu pacientes de 616 municípios de 25 Estados. Neste período foram registrados 123.275 atendimentos ambulatoriais, 12.557 internações e 14.866 cirurgias, sendo quase 90% de usuários do SUS.
O hospital possui 272 leitos e aproximadamente 1.200 funcionários lotados em Jaú e nas Unidades Avançadas de Santa Cruz do Rio Pardo, São Carlos, Itararé e Osvaldo Cruz, todas no Interior paulista, e é mantido pela Fundação Amaral Carvalho.
Uma das técnicas revolucionárias utilizadas pelo hospital para o combate ao câncer de pele e órgãos internos (boca, garganta, esôfago, estômago e intestino), através de endoscopia, é a fotodinâmica.
Nela, o laser é aplicado em tumores previamente submetidos a uma droga fotossensível. O projeto é fruto do programa de uma cooperação técnico-científica da Fundação Amaral Carvalho e do Instituto de Física da USP de São Carlos, com o apoio do Instituto de Oncologia de Moscou, na Rússia. O Centro de Terapia Fotodinâmica, inaugurado em julho de 2001, foi o primeiro do País.
Num intercâmbio técnico-científico entre a Fundação Amaral Carvalho, a Faculdade de Medicina da Unesp de Botucatu, o Hemocentro de Botucatu e o Hemonúcleo Regional de Jaú, o hospital realiza transplantes de medula óssea desde 1996. Até junho de 2003, foram realizados 270 transplantes em pacientes vindos de 15 Estados, todos atendidos pelo SUS. As novas instalações permitem a realização de 10 transplantes simultâneos.
Na área de ensino e pesquisa, o HAC oferece residência médica nas especialidades: oncologia clínica, mastologia, urologia, cirurgia de cabeça e pescoço, além do programa de educação continuada em enfermagem.