A Série A-2 do Campeonato Paulista de 2003 será nos mesmos moldes da A-3: com 16 clubes divididos em duas chaves regionalizadas de oito. Os times se enfrentam em dois turnos, dentro do próprio grupo.
Os dois melhores colocados avançam para as semifinais e o pior de cada chave cai para a Série A-3. Subirão para a Série A-1 em 2004, o campeão e vice, ou seja, os dois primeiros colocados do quadrangular.
A temporada terá um curto espaço. A Série A-2, assim como as outras duas divisões, começa em 26 de janeiro e termina dia 30 de março. A intenção da Federação Paulista de Futebol é não misturar datas com o Campeonato Brasileiro que começa em março.
Alguns dirigentes da Série A-2 queriam a união com a Série A-3, formando uma divisão única. No entanto, com o pouco tempo de disputa, O presidente da Federação Paulista, Eduardo José Farah, optou por manter o regulamento de 2002.
Os grupos
Grupo 1: Matonense, São Carlense, São Bento, Atlético Sorocaba, Nacional, Bragantino, Flamengo de Guarulhos e São José. Grupo 2: Rio Preto, Mirassol, Taquaritinga, Oeste, Bandeirante, Comercial, Olímpia e Francana.
