No aspecto religioso, Bauru ganhou destaque entre os imigrantes japoneses. A cidade foi a primeira da região a divulgar a doutrina Seicho-No-Ie, por iniciativa do imigrante Goichi Kosaka. Além disso, a sede nacional da Igreja Tenrikyo fica em Bauru.
Localizada na Vila Independência, a igreja surgiu em 1939. O ímpeto missionário de seus freqüentadores fez com que a igreja crescesse rapidamente. Só em Bauru vivem, atualmente, mais de 100 missionários. Para conseguir esse título, os interessados têm de passar por um curso de formação na Dendotyo bauruense.