E as polêmicas que envolvem o juiz federal Flávio Roberto de Souza, que esteve responsável pelo caso de Eike Batista, foi obrigado a devolver R$ 599 mil em valores desviados pelo magistrado, após o Ministério Público Federal apresentar uma denúncia contra ele pelos crimes de peculato, falsidade ideológica e extravio e inutilização de documentos em atos processuais.
Souza era titular da 3ª Vara Federal Criminal do Rio de Janeiro, até ser afastado de suas funções depois de ter sido flagrado dirigindo o Porsche Cayenne do empresário Eike Batista que havia sido apreendido.
Segundo o Tribunal Regional Federal da 2 ª Região, o valor devolvido corresponde a quase 100% dos valores em moeda estrangeira que foram apropriados de forma indevida e ilegal pelo juiz em uma ação criminal por tráfico de drogas. O magistrado ainda cometeu falsidade ideológica para desviar recursos públicos em duas situações. A Corregedoria Regional da Justiça Federal da 2ª Região, informou que a diferença relativa a quantia restante será objeto de procedimento administrativo, na tentativa de pressionar Souza a ressarcir o dinheiro.
A Justiça retirou o sigilo dos cinco processos administrativos disciplinares que estão em curso contra Souza atualmente.