Em Franca são coletados aproximadamente 41.000 m³ de esgoto por dia. De acordo com a Sabesp, 98% dos dejetos são tratados para remoção dos poluentes. O esgoto tratado é encaminhado para o córrego dos Bagres, que deságua no Rio Sapucaí. Os poluentes restantes, retirados da água, são na maior parte formados por matéria orgânica, uma espécie de lodo. Essa matéria é tratada em biodigestores, por processo biológico anaeróbico - sem oxigênio. É quando ocorre a formação de biogás, composto por 70% de metano e o restante por dióxido de carbônico. O depurador que será instalado na ETE de Franca captará o biogás e o transformará em biometano.