Um dos programas municipais que são abastecidos pelos relatórios do Comitê de Mortalidade Materno-Infantil é o Programa da Saúde da Mulher. Instituído para pensar a saúde feminina de maneira integral, envolve ações em relação ao câncer, doenças sexualmente transmissíveis (DSTs), climatério, prevenção de osteoporose, amamentação, pré-natal, parto e pós-parto, planejamento familiar e atendimento odontológico.
Instituído na década de 80, quando havia apenas um ginecologista na rede pública de saúde para atender toda a população feminina em idade fértil e os resultados dos exames de Papanicolaou (para detectar câncer de colo de útero) demoravam até 40 dias para serem concluídos, o programa foi responsável por motivar a contratação de pelo menos um ginecologista por unidade de saúde, descentralizar a coleta do exame de Papanicolaou e oferecer em toda rede métodos contraceptivos.
Outras melhorias conquistadas desde a implantação do programa envolveram a inauguração do Serviço Municipal de Ultra-sonografia, destinado à realização de pelo menos um ultra-som por gestação; do Programa de Humanização do Nascimento e Parto, criado pelo Ministério da Saúde; Ambulatório de Planejamento Familiar e Ambulatório de Gestação de Alto Risco, estes dois últimos em parceria com a Maternidade Santa Izabel.
O Programa de Saúde da Mulher é destinado a todas as mulheres usuárias do Sistema Único de Saúde (SUS), priorizando o atendimento às gestantes e mulheres que pretendem realizar o exame de Papanicolaou, através de agendamento prévio.
De acordo com Maria Cecília Sgavioli, responsável pela seção de programas da Secretaria Municipal de Saúde, atualmente 30 ginecologistas e 49 enfermeiros, além do restante das equipes das unidades de saúde, estão envolvidos com o Programa de Saúde da Mulher, que realizou 89.422 consultas ginecológicas em 2004.